В нашем Соборе чудотворный Образ Спаса Нерукотворного находится на аналое у правого клироса.
Он тесно связан с жизнью Императора Петра Великого и был его любимым образом. Написанный, предположительно в 1676 году для Царя Алексея Михайловича известным московским иконописцем Симоном Федоровичем Ушаковым, к Царю Петру образ перешел от матери, Наталии Кирилловны, и всегда сопутствовал ему в походах. Это тот самый образ, пред которым Царь преклонял колена при основании Петербурга, испрашивая благословение Божие на новую столицу.
Святыни несут веру и надежду прихожанам. Главные святыни – Нерукотворный Образ Спасителя – на аналое у правого клироса и икона «Всех Скорбящих Радость» – на аналое у левого клироса.
"Всех скорбящих Радость" - одна из досточтимых икон Спасо-Преображенского собора, куда была перенесена из Скорбященской церкви на Шпалерной после ее закрытия в 1932 году.
Изначальный образ Божией Матери, получивший название "Всех скорбящих Радость", прославился в 1688 году.
Икона, находящаяся в Спасо-Преображенском соборе, относится к неустановленным спискам с известной иконы сестры Петра Первого Натальи Алексеевны и датируется 18 веком.
Среди икон старого письма одной из центральных является икона великомученика и целителя Пантелеймона с частицей мощей.
Икона, по преданию, была написана по заказу Петра I для храма святого великомученика и целителя Пантелеимона (на ул. Пестеля, Санкт-Петербург), а в 1936 году после закрытия храма икона была перенесена в Спасо-Преображенский собор, где и находится сейчас.
В левом приделе находится складень (складной алтарь) с образами Преображения Господня, великомученика Пантелеймона и святого царя Константина. Складной алтарь подарил в 1900 году полковому лазарету командир полка генерал-майор, член императорской семьи великий князь Константин Константинович.
В правом пределе находиться мощевик, в котором находиться множество мощей святых, в основном мучеников первых веков христианства. В том числе в нем находятся мощи святого священномученика Климента, папы Римского, в честь которого освящен левый придел собора.